磷进入湖泊后便参加生态系统的物质循环，构成水生物个体和生物群落，并经由自养生物和异差生物等组成的营养级依次转化迁移。磷不象氮在生态系统中通过气、液、固三相转换进行循环，无气相形式存在，主要在水－底泥间循环，被称为底质循环。